真菌介导肿瘤进程与治疗响应
对45例胃癌患者的癌变组织及癌旁正常组织活检样本进行内转录间隔区（Internal transcribed spacer，ITS2）分析发现，胃癌组织中真菌α多样性降低，白色念珠菌、金黄弯孢壳菌、醋酸镰孢菌、水渠镰孢菌以及链格孢属（C. albicans, Arcopilus aureus, Fusicolla acetilerea, Fusicolla aquaeductuum, Alternaria）等真菌丰度显著升高。值得注意的是，蒙特维迪曲霉、光滑念珠菌、沙生青霉和波氏赛托酵母（Aspergillus montevidensis, C. glabrata, Penicillium arenicola, Saitozyma podzolica）等菌属在胃癌患者中呈现显著减少趋势。一项宏基因组学研究进一步证实，胃癌患者真菌群落中念珠菌属、杰丁汉逊酵母和酿酒酵母存在较高丰度。
通过生物信息学分析61例胃癌患者样本发现，正常组织与肿瘤病灶间的念珠菌属丰度未见显著差异，但肿瘤病灶中索氏酵母属丰度显著升高。关于念珠菌作用机制的矛盾结论可能源于研究人群差异和分析方法不同，需要建立标准化研究方案并通过多中心协作阐明其在胃癌发生中的具体作用。文献综述指出，白色念珠菌可通过多种途径参与胃癌进展：产生致癌性乙醛、诱导促炎细胞因子（CXCL1、CXCL2、CXCL3、TNFα和IL18）、通过分子模拟补体受体3蛋白介导免疫逃逸，以及激活Th17反应经IL23通路促进血管生成和肿瘤生长。
肝癌
对17例肝细胞癌（HCC）患者和11例肝硬化患者的粪便样本进行ITS1测序显示，HCC组患者真菌α多样性显著降低。尽管该研究未设置健康对照组，但HCC病例中白色念珠菌检出率较高。机制研究表明，白色念珠菌可通过调节宿主代谢和激活NLRP6炎症通路促进HCC进展。另一项基于ITS2 rDNA测序的研究发现，相较于对照组，HCC患者肠道真菌多样性显著下降。该研究提示肠道内白色念珠菌和马拉色菌的异常定植可能参与HCC发生发展。动物实验进一步证实，白色念珠菌与马拉色菌在肠道的异常增殖可驱动HCC发展进程。
乳腺癌
最新研究表明，乳腺癌患者（尤其是50岁以上群体）肿瘤组织中枝孢菌属（特别是球孢枝孢菌）呈现显著富集特征。值得注意的是，肿瘤内球形马拉色菌的存在与乳腺癌患者总生存期缩短呈现显著相关性。这种常驻于健康人群皮肤及母乳中的共生真菌，其与不良预后的关联提示其可能参与肿瘤进展机制。研究同时发现，另一种皮肤共生真菌限制马拉色菌也存在于乳腺癌样本中。这些真菌的异常定植可能与肿瘤患者皮肤屏障功能受损及免疫微环境改变相关，其具体机制亟待深入探索。值得注意的是，乳腺癌组织中马拉色菌、曲霉菌与细菌的共存现象提示真菌-细菌相互作用可能在肿瘤生物学行为调控中发挥协同效应。
通过层次聚类分析发现，不同乳腺癌亚型（包括激素受体阳性型、三阴性型、HER2阳性型及三阳性型）具有独特的真菌群落特征。其中仅有念珠菌属、曲霉属、多孢微孢子虫属、小克银汉霉属、球孢子菌属、地霉属和红酵母属（Candida, Aspergillus, Pleistophora, Cunninghamella, Coccidioides, Geotrichum, Rhodotorula）等七个菌属在多个亚型中普遍存在。链格孢属、阿耶罗菌属、小克银汉霉属、毛癣菌属、线黑粉菌属、表皮癣菌属和根毛霉属（Alternaria, Ajellomyces, Cunninghamella, Trichophyton, Filobasidiella, Epidermophyton, Rhizomucor）等真菌特征则特异性地存在于一个或多个乳腺癌亚型，而在健康对照中完全缺失。这种真菌群落的异质性可能受激素水平、免疫应答状态及局部组织微环境等多重因素调控。
前列腺癌
一项横断面研究对比分析了31例前列腺癌患者和34例健康对照的血浆真菌群落特征。结果显示两组α多样性无显著差异，但β多样性存在显著区别。前列腺癌样本中丝担菌目、火丝菌科及黑色隐球菌呈现特异性富集。通过层次聚类分析发现，超过82%的癌组织样本对链格孢属、马拉色菌属、念珠菌属和枝孢菌属（Alternaria, Malassezia, Candida, Cladosporium）呈现强杂交信号。毛孢子菌属、枝芽孢菌属和红酵母属（Trichosporon, Cladophialophora, Rhodotorula）等真菌则以不同比例被检出。62%的病例中隐球菌属和巴氏酵母属呈现中低强度杂交信号，而80%以上样本中费氏壳属（暗色孢科）呈现中等强度杂交信号。尽管链格孢属和马拉色菌属广泛存在于多种肿瘤，但丝担菌目（Filobasidiales）和火丝菌科（Pyronemataceae）在前列腺癌中的特异性富集，提示前列腺腺体特有的微环境可能塑造了该肿瘤独特的真菌-宿主互作模式。
肺癌